publications

2022

1. K27M in canonical and noncanonical H3 variants occurs in distinct oligodendroglial cell lineages in brain midline gliomas

   Selin Jessa*, Abdulshakour Mohammadnia*, Ashot S Harutyunyan*, Maud Hulswit, Srinidhi Varadharajan, Hussein Lakkis, Nisha Kabir, Zahedeh Bashardanesh, Steven Hébert, Damien Faury, Maria C Vladoiu, Samantha Worme, Marie Coutelier, Brian Krug, Augusto Faria Andrade, Manav Pathania, Andrea Bajic, Alexander G Weil, Benjamin Ellezam, Jeffrey Atkinson, Roy W R Dudley, Jean-Pierre Farmer, Sebastien Perreault, Benjamin A Garcia, Valérie Larouche, Mathieu Blanchette, Livia Garzia, Aparna Bhaduri, Keith L Ligon, Pratiti Bandopadhayay, Michael D Taylor, Stephen C Mack, Nada Jabado^, and Claudia L Kleinman^

   Nature Genetics 2022

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2021

1. Mapping Angiopoietin1 expression in the developing and adult brain

   Xin Wei, Selin Jessa, Claudia L Kleinman, and Timothy N Phoenix

   Developmental Neuroscience 2021
2. Epigenetically defined therapeutic targeting in H3.3G34R/V high-grade gliomas

   Stefan R Sweha, Chan Chung, Siva Kumar Natarajan, Pooja Panwalkar, Matthew Pun, Amer Ghali, Jill Bayliss, Drew Pratt, Anand Shankar, Visweswaran Ravikumar, Arvind Rao, Marcin Cieslik, Kari Wilder-Romans, Andrew J Scott, Daniel R Wahl, Selin Jessa, Claudia L Kleinman, Nada Jabado, Alan Mackay, Chris Jones, Daniel Martinez, Mariarita Santi, Alexander R Judkins, Viveka Nand Yadav, Tingting Qin, Timothy N Phoenix, Carl J Koschmann, Suzanne J Baker, Arul M Chinnaiyan, and Sriram Venneti

   Science Translational Medicine 2021
3. ZFTA-RELA Dictates Oncogenic Transcriptional Programs to Drive Aggressive Supratentorial Ependymoma

   Amir Arabzade, Yanhua Zhao, Srinidhi Varadharajan, Hsiao-Chi Chen, Selin Jessa, Bryan Rivas, Austin J Stuckert, Minerva Solis, Alisha Kardian, Dana Tlais, Brian J Golbourn, Ann-Catherine J Stanton, Yuen San Chan, Calla Olson, Kristen L Karlin, Kathleen Kong, Robert Kupp, Baoli Hu, Sarah G Injac, Madeline Ngo, Peter R Wang, Luz A De Leon, Felix Sahm, Daisuke Kawauchi, Stefan M Pfister, Charles Y Lin, H Courtney Hodges, Irtisha Singh, Thomas F Westbrook, Murali M Chintagumpala, Susan M Blaney, Donald W Parsons, Kristian W Pajtler, Sameer Agnihotri, Richard J Gilbertson, Joanna Yi, Nada Jabado, Claudia L Kleinman, Kelsey C Bertrand, Benjamin Deneen, and Stephen C Mack

   Cancer Discovery 2021

2020

1. Histone H3.3G34-Mutant Interneuron Progenitors Co-opt PDGFRA for Gliomagenesis

   Carol C L Chen*, Shriya Deshmukh*, Selin Jessa*, Djihad Hadjadj*, Véronique Lisi, Augusto Faria Andrade, Damien Faury, Wajih Jawhar, Rola Dali, Hiromichi Suzuki, Manav Pathania, Deli A, Frank Dubois, Eleanor Woodward, Steven Hébert, Marie Coutelier, Jason Karamchandani, Steffen Albrecht, Sebastian Brandner, Nicolas De Jay, Tenzin Gayden, Andrea Bajic, Ashot S Harutyunyan, Dylan M Marchione, Leonie G Mikael, Nikoleta Juretic, Michele Zeinieh, Caterina Russo, Nicola Maestro, Angelia V Bassenden, Peter Hauser, József Virga, Laszlo Bognar, Almos Klekner, Michal Zapotocky, Ales Vicha, Lenka Krskova, Katerina Vanova, Josef Zamecnik, David Sumerauer, Paul G Ekert, David S Ziegler, Benjamin Ellezam, Mariella G Filbin, Mathieu Blanchette, Jordan R Hansford, Dong-Anh Khuong-Quang, Albert M Berghuis, Alexander G Weil, Benjamin A Garcia, Livia Garzia, Stephen C Mack, Rameen Beroukhim, Keith L Ligon, Michael D Taylor, Pratiti Bandopadhayay, Christoph Kramm, Stefan M Pfister, Andrey Korshunov, Dominik Sturm, David T W Jones, Paolo Salomoni, Claudia L Kleinman^, and Nada Jabado^

   Cell 2020

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2019

1. Stalled developmental programs at the root of pediatric brain tumors

   Selin Jessa, Alexis Blanchet-Cohen, Brian Krug, Maria Vladoiu, Marie Coutelier, Damien Faury, Brice Poreau, Nicolas De Jay, Steven Hébert, Jean Monlong, W Todd Farmer, Laura K Donovan, Yixing Hu, Melissa K McConechy, Florence M G Cavalli, Leonie G Mikael, Benjamin Ellezam, Maxime Richer, Andréa Allaire, Alexander G Weil, Jeffrey Atkinson, Jean-Pierre Farmer, Roy W R Dudley, Valerie Larouche, Louis Crevier, Steffen Albrecht, Mariella G Filbin, Hervé Sartelet, Pierre-Eric Lutz, Corina Nagy, Gustavo Turecki, Santiago Costantino, Peter B Dirks, Keith K Murai, Guillaume Bourque, Jiannis Ragoussis, Livia Garzia, Michael D Taylor^, Nada Jabado^, and Claudia L Kleinman^

   Nature Genetics 2019

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2018

1. Genome-wide discovery of somatic regulatory variants in diffuse large B-cell lymphoma

   Sarah E Arthur, Aixiang Jiang, Bruno M Grande, Miguel Alcaide, Razvan Cojocaru, Christopher K Rushton, Anja Mottok, Laura K Hilton, Prince Kumar Lat, Eric Y Zhao, Luka Culibrk, Daisuke Ennishi, Selin Jessa, Lauren Chong, Nicole Thomas, Prasath Pararajalingam, Barbara Meissner, Merrill Boyle, Jordan Davidson, Kevin R Bushell, Daniel Lai, Pedro Farinha, Graham W Slack, Gregg B Morin, Sohrab Shah, Dipankar Sen, Steven J M Jones, Andrew J Mungall, Randy D Gascoyne, Timothy E Audas, Peter Unrau, Marco A Marra, Joseph M Connors, Christian Steidl, David W Scott, and Ryan D Morin

   Nature Communications 2018
2. chromswitch: A flexible method to detect chromatin state switches

   Selin Jessa, and Claudia L Kleinman

   Bioinformatics 2018

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2017

1. Enhancing knowledge discovery from cancer genomics data with Galaxy

   Marco A Albuquerque, Bruno M Grande, Elie J Ritch, Prasath Pararajalingam, Selin Jessa, Martin Krzywinski, Jasleen K Grewal, Sohrab P Shah, Paul C Boutros, and Ryan D Morin

   GigaScience 2017